Mutua Balear nació en 1936 como consecuencia de un proceso de transformación de la Mutualidad de Accidentes de Mallorca. Empezó a funcionar de forma efectiva en 1939 y adquirió en pocos años un notable crecimiento a nivel nacional que llevó a sus mutualistas a acordar el traspaso de la mayoría de su negocio a una sociedad de seguros de nueva creación (Mare Nostrum) en 1945.

A pesar del traspaso, Mutua Balear continuó operando en algunos sectores hasta que en 1966 renunció a su ámbito nacional y se convirtió en Mutua Patronal de Accidentes de Trabajo de acuerdo con la nueva legislación de la Seguridad Social. Pronto alcanzó el liderazgo del sector en Baleares, lo que le permitió absorber otras dos mutuas, la de Patronos Agrícolas de Mallorca n° 209 y la Felanitgense n° 95, obteniendo así una cuota de mercado cercana al 50% en la comunidad.

El proceso de expansión de las empresas de Baleares hacia Canarias trajo consigo el inicio de actividades en este archipiélago, lo que derivó en 1996 en la fusión de la entidad con la Mutua Guanarteme n° 125.

Actualmente, Mutua Balear cuenta con una población protegida de más de 280.000 trabajadores y 27.000 empresas en toda España